Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EdaO54693 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EdaO54693 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EdaO54693 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EdaO54693 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms