Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rabep1O35551 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rabep1O35551 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Rabep1O35551 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rabep1O35551 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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