Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd2O35392 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd2O35392 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms