Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ColqO35348 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ColqO35348 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ColqO35348 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ColqO35348 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ColqO35348 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ColqO35348 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ColqO35348 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ColqO35348 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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