Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms