Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf5O35326 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf5O35326 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms