Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f3O35261 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms