Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkd2O35245 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2O35245 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms