Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CenpaO35216 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CenpaO35216 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms