Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RrhO35214 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RrhO35214 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RrhO35214 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms