Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scarb2O35114 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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