Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ArxO35085 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ArxO35085 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ArxO35085 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ArxO35085 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ArxO35085 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ArxO35085 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms