Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn4O35054 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms