Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LhbO09108 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LhbO09108 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LhbO09108 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LhbO09108 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LhbO09108 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms