Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hps1O08983 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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