Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PbsnO08976 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PbsnO08976 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PbsnO08976 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms