Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MttpO08601 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MttpO08601 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MttpO08601 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MttpO08601 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MttpO08601 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MttpO08601 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MttpO08601 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MttpO08601 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MttpO08601 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MttpO08601 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms