Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec22bO08547 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec22bO08547 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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