Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm379J3QQ19 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm379J3QQ19 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Gm379J3QQ19 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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