Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccer2J3QPU5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccer2J3QPU5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms