Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm8356J3QPD3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm8356J3QPD3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm8356J3QPD3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm8356J3QPD3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm8356J3QPD3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8356J3QPD3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8356J3QPD3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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