Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700014D04RikJ3QMS2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700014D04RikJ3QMS2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms