Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21866J3QMH4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21866J3QMH4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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