Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930544D05RikJ3QK56 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms