Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn34c3J3QJW5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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