Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20830J3KML6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm20830J3KML6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20830J3KML6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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