Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pot1bH7BX60 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pot1bH7BX60 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms