Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm29394H3BIW7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm29394H3BIW7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms