Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arfip1G5E8V9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfip1G5E8V9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms