Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HrcG5E8J6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HrcG5E8J6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms