Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sh3tc1G3X9F6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3tc1G3X9F6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms