Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nccrp1G3X9C2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nccrp1G3X9C2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms