Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Susd5G3UW60 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms