Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm8005F6YKY3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm8005F6YKY3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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