Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SmgcF6VRN1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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