Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm340F6RGI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm340F6RGI3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms