Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm7945F6QI24 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms