Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms