Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf4E9QAP7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf4E9QAP7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms