Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3c2bE9QAN8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3c2bE9QAN8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms