Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms