Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms