Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpfE9Q3P4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms