Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms