Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms