Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt78E9Q0F0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt78E9Q0F0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms