Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdr1E9Q0B4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdr1E9Q0B4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms