Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm20425E9Q035 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20425E9Q035 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms