Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph10bE9PYQ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rsph10bE9PYQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms