Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r177E9PXM3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r177E9PXM3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms